1个点和3个点的发票区别在于其抵扣的增值税金额不一样。

区别：3个点发票的抵扣金额要比1个点发票的抵扣金额多，开票一个点，增值税按不含税价格乘以1%，开票3个点，增值税按不含税价乘以3%。

一个点的专票是税率为1%，三个点专票是3%，税率不一样，交的税就不样。在其他条件相同的情况下，扣除额不同，纳税人要缴纳的税额也不同。

拓展知识：增值税发票是分为两种，一种是增值税普通发票，而另外一种就是增值税专用发票，这两种发票都是有效的增值税发票。普通发票的内容是买方、销售单位、货物或者服务名称、货物或者服务的数量和计量单位、单价和合价、开票单位、收款人和开票日期等内容外，增值税专用发票除此外还包括纳税人的税务登记号，不含增值税金额、适用税率、应纳增值税金额等内容。